司法協作是指不同國家或地區的司法管轄區之間，基於國際公約、雙邊協定及自身法律制度等，相互委託代為進行特定訴訟行為（如送達文書、調查取證等），使涉跨境事宜的訴訟程序得以有效進行。
根據《中華人民共和國澳門特別行政區基本法》的相關規定，在“一國兩制”的前提下，澳門特別行政區依法進行司法協作工作。
在澳門特區開展的刑事及民商事司法協作中，除非適用的國際公約或雙邊協定另有規定，否則會由檢察院依法負責接收、傳送司法協作的請求、處理相關通知事宜的工作，以及促成相關程序的進行，並提供法律及專業技術的協助。另外，按司法協作請求的類型、案件所涉訴訟階段，檢察院亦依法參與當中的執行及提供意見的工作。